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Questo studio descrive un nuovo encefalopatia epilettica dello sviluppo grave causata da varianti bialleliche rare nel gene RNU2-2, caratterizzata da un fenotipo clinico coerente e da alterazioni specifiche dello splicing rilevabili tramite sequenziamento dell'RNA nei fibroblasti.
Questo studio utilizza il sequenziamento nanopore a lunga lettura per creare il primo catalogo dettagliato di varianti strutturali nelle popolazioni del Medio Oriente e del Nord Africa, rivelando una significativa diversità genomica precedentemente inesplorata e riducendo drasticamente l'onere interpretativo per la diagnosi clinica in queste popolazioni.
Questo studio multicentrico indiano valida l'efficacia di un punteggio di rischio genetico (GRS) per il diabete di tipo 1 come strumento diagnostico unificato, evidenziando tuttavia come le soglie europee sottostimino il rischio genetico nella popolazione indiana e come l'accuratezza diagnostica vari in base allo stato degli autoanticorpi e all'età di esordio, rendendo necessaria un'ottimizzazione specifica per l'ascendenza.
Questo studio dimostra che l'integrazione del sequenziamento dell'RNA nel flusso diagnostico per le malattie mitocondriali pediatriche non diagnosticate aumenta significativamente il rendimento diagnostico rivelando varianti patogene criptiche, come errori di splicing e meccanismi di fuga dal decadimento mediato da nonsense, che rimangono invisibili alle sole analisi del DNA.
Uno studio prospettico caso-controllo su pazienti turchi ha utilizzato il sequenziamento di nuova generazione ad alta risoluzione per identificare specifici alleli HLA associati a un aumentato rischio o a un effetto protettivo contro l'apnea ostruttiva del sonno, suggerendo una base immunogenetica per la malattia.
Questo studio suggerisce che le varianti del gene HSP90AA1 possano rappresentare una causa autosomica dominante di infertilità maschile umana, un meccanismo di ereditarietà atipico rispetto alla maggior parte dei geni associati a tale condizione.
Questo studio del progetto DECIPHERD in Cile dimostra l'utilità dell'esoma sequenziamento per diagnosticare malattie rare in una popolazione diversamente clinica, identificando che la presenza di anomalie congenite multiple e disturbi dello sviluppo neurologico aumenta il rendimento diagnostico, mentre l'uso precedente di pannelli genici lo riduce, senza che l'ascendenza genetica influenzi i risultati.
Questo studio presenta EDGAR, un framework di deep learning che ricostruisce la suscettibilità alle malattie nel corso della vita dai dati sanitari elettronici, migliorando le analisi genetiche e rimuovendo i fattori di confondimento sistemici che distorcono le correlazioni tra malattie e tratti socio-economici.
Il documento presenta COXMM, un nuovo modello misto a rischi proporzionali di Cox che permette di stimare in modo accurato l'ereditabilità dei tratti tempo-evento, superando i limiti degli approcci tradizionali e fornendo nuove prospettive sulla struttura genetica delle malattie longitudinali.
Questo studio di associazione su tutto il trascrittoma multi-tessutale ha identificato 29 geni di rischio per il disturbo da deficit di attenzione/iperattività, inclusi sei candidati nuovi, fornendo nuove intuizioni sulla loro architettura genetica complessa e su potenziali bersagli terapeutici.
Il documento presenta il GPMap, un repository open-source che integra oltre 15.000 tratti complessi e 2,7 milioni di misurazioni molecolari per mappare le relazioni pleiotropiche, facilitando la comprensione dei meccanismi delle malattie, il miglioramento delle inferenze causali e la previsione del successo dei trial clinici.
Questo studio ha identificato nuovi segnali genetici associati alla fibrosi polmonare idiopatica, in particolare nei geni PMF1 ed EPN3, applicando modelli genetici recessivi e dominanti che hanno rivelato meccanismi patogenetici non catturati dai tradizionali modelli additivi.
Questo studio ha identificato otto loci genetici condivisi e due nuove associazioni varianti attraverso 12 sistemi organici, rivelando meccanismi biologici comuni alla fibrosi che potrebbero guidare lo sviluppo di nuove terapie.
Questo studio dimostra che i modelli linguistici di grandi dimensioni dotati di capacità di ragionamento possono automatizzare con alta accuratezza l'estrazione di prove cliniche (codice PS4) dalla letteratura genomica, supportando un flusso di lavoro ibrido che combina l'efficienza dell'IA con la supervisione umana.
Questo studio, analizzando i genotipi HLA ad alta risoluzione di oltre 70.000 individui, ha identificato quindici nuove associazioni significative tra varianti HLA e condizioni spesso sottostimate come allergie e reazioni avverse ai farmaci, tra cui una forte correlazione tra HLA-DRB1*04:01 e la sensibilità al cefaclor.
Questo studio ha condotto un'analisi di associazione genome-wide su quasi 700.000 individui, identificando 80 varianti genetiche significative per la gravità dei sintomi del disturbo d'ansia generalizzata e rivelando una significativa ereditabilità genetica, correlazioni con altre condizioni di salute mentale e fisica, e l'implicazione di processi sinaptici e assonali.
Uno studio di randomizzazione mendeliana su scala fenomica rivela che l'espressione di GLP1R, sebbene protettiva contro 58 malattie, aumenta il rischio di 34 patologie (inclusi problemi neonatali e carenza di vitamina D) e di 22 malattie legate all'invecchiamento, mentre l'inibizione di CETP risulta protettiva solo per il cuore.
Questo studio dimostra che l'integrazione dello stato di espansione CTG18.1 con un punteggio di rischio poligenico specifico per la distrofia corneale endoteliale di Fuchs consente una previsione genomica accurata della progressione della malattia verso il trapianto, supportando strategie di stratificazione del rischio clinico personalizzato.
Il paper presenta DAVP, un sistema di intelligenza artificiale agentic gerarchico che rivoluziona la diagnosi genetica delle malattie rare valutando le varianti nel contesto clinico specifico del paziente, superando le prestazioni degli esperti umani in termini di accuratezza e velocità.
Questo studio dimostra che le ripetizioni in tandem corte (STR) contribuiscono in modo significativo all'ereditabilità mancante della perdita uditiva legata all'età, spiegando in particolare una porzione maggiore della componente metabolica rispetto a quella sensoriale e identificando nuove associazioni genetiche che influenzano l'espressione e lo splicing genico.